Група 1
Сіяні
"Хазар" (AZE)/"Лех" (POL), "Нафтан" (BLR)/"Црвена Звезда" (SRB), "Діфферданж" (LUX)/"Гент" (BEL), "Левськи" (BUL)/"Сараєво" (BIH), "Олімпік" (FRA), "Спарта" Прага (CZE)
Несіяні
"Слован" (SVK)/"Відеотон" (HUN), "Ескішехірспор" (TUR)/"Сент-Джонстон" (SCO), "Ювяскіла" (FIN)/"Зета" (MNE), "Жальгіріс" (LTU)/"Адміра-Ваккер" (AUT), АІК (SWE)/"Хабнарфйордур" (ISL), "Омонія" (CYP)
Група 2
Сіяні
"Динамо" Москва (RUS), "Бурсаспор" (TUR), "Янг Бойз" (SUI)/"Зімбру" (MDA), "Стяуа" Бухарест (ROU), "Мура" (SVN)/ЦСКА Софія (BUL), "Ліверпуль" (ENG)
Несіяні
"Осієк" (CRO)/"Кальмар" (SWE), "Арсенал" Київ (UKR), "Спартак" Трнава (SVK)/"Слайго Роверс" (IRL), "Ренова" (MKD)/"Гомель" (BLR), "Данді Юнайтед" (SCO), "Маккабі" Нетанія (ISR)/"КуПС" (FIN)
Група 3:
Сіяні
"Ганновер" (GER), "Атлетик" (ESP), "Металург" Лієпая (LVA)/"Легія" (POL), "Анжі" (RUS)/"Гонвед" (HUN), "Русенборг" (NOR)/"Ордабаси" (KAZ), "Марітіму" (POR)
Несіяні
"Шахтар" Солігорськ (BLR)/"Рід" (AUT), "Серветт" (SUI)/"Гандзасар" (ARM), "Локомотив" Пловдив (BUL)/"Вітесс" (NED), "Інтер" Баку (AZE)/"Астерас" (GRE), "Широки Брієг" (BIH)/"Сент-Патрікс" (IRL), "Славен" (CRO)/"Портадаун" (NIR)
Група 4:
Сіяні
"Металург" Лієпая (LVA)/"Легія" (POL), АПОЕЛ (CYP)/"Сеніца" (SVK), "Херенвен" (NED), "Інтарнаціонале" (ITA), "Дачія" (MDA)/"Ельфсборг" (SWE), "Рапід" (AUT)
Несіяні
"Рапід" Бухарест (ROU)/МюПа (FIN), "Хорсенс" (DEN), "Хайдук" (CRO)/"Сконто" (LVA), "Войводина" (SRB)/"Судува" (LTU), "Рух" (POL)/"Металург" Скоп'є (MKD), "Тирана" (ALB)/"Олесунн" (NOR)
Група 5:
Сіяні
"Металург" Донецьк (UKR)/"Челик" (MNE), ПАОК (GRE), "Генк" (BEL), "Левадія" (EST)/"Анортосіс" (CYP), "Твенте" (NED)/"Інтер" Турку (FIN)
Несіяні
"Мілс-Урсідос" (MDA)/"Актобе" (KAZ), "Орхус" (DEN)/"Діла" (GEO), "Бней-Єгуда" (ISR)/"Ширак" (ARM), "Олімпія" (SVN)/"Тромсе" (NOR), "Млада-Болеслав" (CZE)/"Тор" (ISL)
